דוד בן גוריון, שדגל בעיקרון הממלכתיות ואכיפת סמכות המדינה על כלל הארגונים
הצבאיים שפעלו טרום הקמתה, החליט בספטמבר 1948 להורות על פרוק ארגון הפלמ"ח והטמעתו
בצבא החדש שהוקם.
אחרי שבן גוריון התיר השתתפות חיילים בכינוס הפלמ"ח, שנועד
לאוקטובר 1949,הוא חזר בו מהסכמתו והורה לאסור על חיילים בכל הרמות להשתתף בו. זאת
לאחר שהתברר לו כי צפויים לעלות בכינוס נושאים פוליטיים וכי הוא יישא אופי
צבאי.
על אף הוראת הרמטכ"ל רא"ל יעקב דורי, החליטו כמה קצינים לא להישמע
להוראה ולהשתתף בכינוס.
ארכיון צה"ל חושף לראשונה את המסמכים העיקריים של
פרשה זו, ובכלל זה את הפרוטוקולים של הדיונים המשפטיים נגד סא"ל יצחק רבין, רס"ן
צבי זמיר, רס"ן דוד אלעזר ורס"ן חיים בר-לב.